1、先安装Step7，再安装WinCC flexible。缺省安装WinCC flexible会检测Step7的安装情况，如果检测到有Step7，WinCC flexible会自动安装集成选项；而自定义安装WinCC flexible时，必须选择集成选项才可以。
如果先安装了WinCC flexible，再安装Step7，就不能集成了。只能先卸载，再安装。
2、参考:《如何把wincc flexible 和step 7项目集成在一起》
http://www2.ad.siemens.com.cn/download/Upload/AS/faq/38797080.pdf 

不能在STEP 7 中集成 WinCC flexible 项目的几种可能的错误原因。 
如果 WinCC flexible 的集成功能为灰色或者不可用，可能是由于以下原因导致。 
如果 WinCC flexible 先于 STEP 7 而被安装，那么必须安装 WinCC flexible 集成选项。
操作说明
通过控制面板调用 WinCC flexible 安装程序并修改安装。
控制面板/添加删除程序/SIMATIC WinCC flexible  按钮： 修改/删除 
激活在 STEP 7 中集成。
“WinCC flexible 集成”和“STEP7”检查框必须选中。
（执行此操作需要 WinCC flexible 安装盘。）
注意
如果 STEP 7 先于 WinCC flexible 安装，WinCC flexible 安装程序会识别已经安装的 STEP 7，并且自动安装与 STEP 7 的集成选项。
如果选择自定义安装 WinCC flexible，请确认激活“与 STEP 7 集成”选项。
如果已经安装了STEP 7 希望更新 STEP 7 程序，例如：安装服务补丁，那么必须重新安装 WinCC flexible 中的与 STEP 7 集成的选项。
操作说明
通过控制面板启动 WinCC flexible 安装程序并修改安装。 
解除在 STEP 7中集成选项。 
然后重新安装并激活与 STEP 7集成选项。
（执行此操作需要 WinCC flexible 安装盘。）
参考：不能在STEP 7 中集成 WinCC flexible 项目的几种可能的错误原因
http://support.automation.siemens.com/CN/view/zh/38797080